「生物多樣性國際碩士學位學程」為跨學院、跨領域的全英語碩士學位學程，由本校生物資源暨農學院、生命科學院、理學院共同合作。學程主要目標在於培養新世代具專業素養與國際視野的生物多樣性保育實務管理人才，並從多元角度探討生物多樣性治理。學程有兩大主軸：生物多樣性科學、生物多樣性保育與利用。課程規劃分為四大領域：生物多樣性原理、研究方法與技術、人文社會與經濟、永續利用。
本校與許多政府及民間組織在生物多樣性保育有良好的緊密合作關係，亦定期與日本、印尼、泰國等國家、地區舉辦年度生物多樣性田野課程。因此，學程學生有機會與不同的學者交流互動，參與田野研究或企業實習，進而體驗臺灣的生物多樣性。
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